清华大学医学院成立于 2001 年 10 月 25 日 ，首任院长由我国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任。 生命科学和医学被认为是当今世界科学技术领域最活跃、最有希望取得关键性突破的学科之一，为此，清华大学决定创建医学院，这是清华为顺应国家发展需要及世界高等教育和科学技术发展的趋势，为向世界一流大学的目标奋进迈出的极为重要的一步。
院系简介
　　依托清华大学作为综合性大学的整体优势，医学院致力于培养具备人文社会科学、自然科学、基础医学及临床医学等相关基础理论知识，既掌握临床技能又具备科学研究能力，能在医学领域从事研究、医疗服务、教学及管理的医学科学家、高级临床医生、医学教育工作者和医学高级管理人才。学制 8 年，学生完成学业，成绩优良者将获得医学博士学位（ M.D. ）。  清华大学医学院
医学院将充分利用清华的师资和实验室条件，完成相关理工学科基础教学任务，抓紧建立起一套比较完整、先进的基础及临床医学的教学体系，吸取国内外先进的教学体系及教学方法的成功经验，逐步做到用英语授课。为此，医学院除了将在国内招聘著名的医学教授和著名医生外，将努力从国内外招聘优秀的中青年医学人才。此外，我院已经聘请并将继续聘请海内外一批著名的教授和医生担任我院的客座教授和顾问。 　　医学院已于2006年 月与解放军总医院（301医院）签订了合作协议，301医院成为清华大学医学院的教学医院，第一批已聘请了22位知名专家作为清华大学的兼职教授，并在科学研究领域开展广泛合作。 　　为使我校在 2011 年前能跻身于国际一流大学之林，校领导已明确提出 “ 要争取在信息、纳米及生命科学上有所突破 ” 这一战略目标。在当今的新的发展形势下，为加强和促进我校生命科学与医学的发展及其与其它工程学科间的交叉合作，清华大学于 2004 年 1 月 9 日 成立 “ 清华大学生命科学与医学研究院 ” 。其主要职能是将分散于全校各院系的有关生命科学、医学及相关的工程学科统一组织和协调起来，建立若干研究所（或研究平台），以利于大跨度的学科交叉和取得重大科技成果。